In oltre 6000 mq di superficie è illustrata l'evoluzione marinara del porto e della città. Nell'edificio, il più antico sopravvissuto tra quelli che componevano l'antico Arsenale delle Galee, è stato ripristinato uno scivolo di varo originale, punto di partenza per la ricostruzione di una galea genovese del XVII secolo, lunga 40 metri e alta a poppa 9 metri, frutto di una ricerca storica durata tre anni.
Non ha un approccio esclusivamente scientifico, ma multimediale ed interattivo. Il visitatore è condotto attraverso sale più tradizionali (sullo sviluppo del porto di Genova, su Cristoforo Colombo, Andrea Doria e la pittura di marina), ma può anche entrare ed esplorare gli ambienti dell'Arsenale, visitare l'armeria della Darsena, assistere all'arrivo dei carichi di argento dalle Americhe a bordo delle galee, sfogliare – virtualmente – preziosi atlanti cinquecenteschi, salire su un brigantino ligure dell'Ottocento, attraversare una tempesta a Capo Horn e veder costruire un veliero in legno sulle spiagge della Liguria, nonché sfogliare le carte e i preziosi strumenti scientifici dell'Istituto Idrografico della Marina.
