Nota anche come Chiesa dei SS. Ambrogio e Andrea, la Chiesa del Gesù fu costruita fra il 1589 ed il 1606, su progetto del gesuita Giuseppe Valeriani. L’edificio fu eretto sull’area in cui sorgeva l’antica chiesa di S. Ambrogio, che nel VI-VII secolo fu sede dei Vescovi milanesi, in esilio dopo l’invasione longobarda. La chiesa è in stile barocco e rappresenta un momento significativo dell'architettura religiosa genovese di fine Cinquecento.
La parte superiore fu portata a termine nel 1892, secondo il disegno originario di Rubens, che risale al 1622. L’impianto è ad aula unica, con cupola centrale. Le campate laterali sono formate da vari pilastri e sormontate da cupolette. L’interno, riccamente decorato con marmi policromi e stucchi dorati, contiene notevolissime opere d’arte, tra cui: sculture ed affreschi di Giovanni Battista Carlone, statue di Bernardo e Giuseppe Carlone, due dipinti di Rubens (la “Circoncisione” ed il “Sant’Ignazio che guarisce un’ossessa”); la bella ”Assunzione” di Guido Reni, ed opere del Piola, del Fiasella, del Castello, del De Ferrari, di Andrea Pozzo, del Passignano e di Simon Vouet. Il grande organo nella controfacciata - in parte ricostruito nell'Ottocento - si deve al fiammingo Willem Hermans.
Negli anni 2001-2004, la Chiesa del Gesù è stata oggetto di una vasta operazione di restauro conservativo, che ha interessato particolarmente il prospetto e le decorazioni plastiche.
